RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 LCE3AQ5TA76 89 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-232ENST00000552331 MUSTN1Q8IVN3 82 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-232ENST00000552331 C5orf56Q8N8D9 126 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-232ENST00000552331 LINC00304Q8N9R0 145 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-232ENST00000552331 ZNF563Q8TA94 476 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-232ENST00000552331 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-232ENST00000552331 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa1.84□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 A0A087WXM4 84 aa1.83□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 SPINT3P49223 89 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 FXYD4P59646 89 aa1.83□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 Q6JHZ5 121 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 BAGE3Q86Y29 109 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 PKD1L3Q7Z443 1732 aa1.82□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 ALKQ9UM73 1620 aa1.81□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 SHPRHQ149N8 1683 aa1.81□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 M0R3E3 92 aa1.81□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 C1orf167Q5SNV9 1468 aa1.81□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 LMTK2Q8IWU2 1503 aa1.81□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 TRGV2A0A075B6R0 118 aa1.8□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 SMIM4Q8WVI0 70 aa1.8□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 Q6ZQY7 126 aa1.79□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 CFAP43Q8NDM7 1665 aa1.78□□□□□ -2.12
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CS-232ENST00000552331 PROK2Q9HC23 129 aa1.78□□□□□ -2.12
CS-232ENST00000552331 ICE1Q9Y2F5 2266 aa1.78□□□□□ -2.13
CS-232ENST00000552331 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CS-232ENST00000552331 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 IGKV4-1P06312 121 aa1.77□□□□□ -2.13
CS-232ENST00000552331 ZNF137PP52743 207 aa1.77□□□□□ -2.13
CS-232ENST00000552331 PP632Q6XCG6 107 aa1.77□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 WIZO95785 1651 aa1.77□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 Q96NJ1 140 aa1.76□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
CS-232ENST00000552331 SDK1Q7Z5N4 2213 aa1.76□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa1.75□□□□□ -2.13
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CS-232ENST00000552331 UBR3Q6ZT12 1888 aa1.75□□□□□ -2.13
CS-232ENST00000552331 CD163L1Q9NR16 1453 aa1.75□□□□□ -2.13
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