RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 H3BRM9 83 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 K7ERJ3 54 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 C5orf38Q86SI9 138 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 SPATA25Q9BR10 227 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 H7C423 109 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 HIGD1BQ9P298 99 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 COL7A1Q02388 2944 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 PRSS2P07478 247 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 SEC11AP67812 179 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 CEND1Q8N111 149 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 TIRAPP58753 221 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 NPC2P61916 151 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 IGHV3-30P01768 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 IGHV3-33P01772 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 A6NDN8 102 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 CCL25O15444 150 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 DAND5Q8N907 189 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 TAX1BP3O14907 124 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 KLK12Q9UKR0 248 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 Q9H8V8 135 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 A0A0J9YXY3 114 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GUV1 79 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 VAMP3Q15836 100 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 LELP1Q5T871 98 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 COX11Q9Y6N1 276 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 DNHD1Q96M86 4753 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 TENM2Q9NT68 2774 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 APOMO95445 188 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 REG3AQ06141 175 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 SS18Q15532 418 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-215ENST00000549143 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 H3BUT2 72 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 SFTA2Q6UW10 78 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 TM2D2Q9BX73 214 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 SMIM13P0DJ93 91 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 ESRGQ1W209 222 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 IGLL5B9A064 214 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 UBE2WQ96B02 151 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 TMEM238C9JI98 176 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 TAL2Q16559 108 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 A0A087WZ39 114 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 A4D1N5 150 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 H7C2G1 150 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 MALP21145 153 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 COX7B2Q8TF08 81 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 NDUFA1O15239 70 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 CRPP02741 224 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 C2orf82Q6UX34 121 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 A6NJY4 79 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 H3BNG1 76 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 PFN2P35080 140 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 C9orf118A6NHY6 69 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 COX7A2LO14548 114 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 LITAFQ99732 161 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 ENHOQ6UWT2 76 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 CFC1BP0CG36 223 aa5.71□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 CFC1P0CG37 223 aa5.71□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 Q9HAA7 133 aa5.71□□□□□ -1.49
CS-215ENST00000549143 LINC00158P58513 81 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-215ENST00000549143 CKS1BP61024 79 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-215ENST00000549143 MIAQ16674 131 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-215ENST00000549143 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-215ENST00000549143 GAGE10A6NGK3 116 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-215ENST00000549143 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-215ENST00000549143 B9D2Q9BPU9 175 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 181.3 ms