RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 GAS8-AS1O95177 125 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 FAM236CP0DP71 79 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 FXYD7P58549 80 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 SFTA2Q6UW10 78 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 NRACQ8N912 160 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 HIVEP1P15822 2718 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 A0A0U1RRA0 63 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 H7C423 109 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 KRTAP10-3P60369 221 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 LAGE3Q14657 143 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 DAND5Q8N907 189 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 MGPP08493 103 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 COX6CP09669 75 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 MUC4Q99102 2169 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-204ENST00000546621 SORL1Q92673 2214 aa5.65□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 LST1O00453 97 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 IGLV1-51P01701 117 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 STHQ8IWL8 128 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 PPP1R17O96001 155 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 INSP01308 110 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 PF4P02776 101 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 LINC00315P59091 139 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 A0A087WWL8 130 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 TMEM223A0PJW6 202 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 HTN1P15515 57 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 TRIAP1O43715 76 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 CD164Q04900 197 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 ZNF876PQ49A33 203 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 TOMM6Q96B49 74 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 F5H697 171 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 TIRAPP58753 221 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 Q6JHZ5 121 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 XCL2Q9UBD3 114 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 DNHD1Q96M86 4753 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 C11orf86A6NJI1 115 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 BCE1O60756 84 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 PRM2P04554 102 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 Q1RN00 199 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 GHRHP01286 108 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 AMELXQ99217 191 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-204ENST00000546621 M0QY20 66 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 PMAIP1Q13794 54 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 A8MZ25 164 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 VCYO14598 125 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-204ENST00000546621 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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