RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00694P0DN24 101 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRO-210ENST00000544244 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRO-210ENST00000544244 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRO-210ENST00000544244 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
PTPRO-210ENST00000544244 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.9□□□□□ -1.78
PTPRO-210ENST00000544244 A0A0J9YXV3 536 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 IGIPA6NJ69 53 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 COX7A2LO14548 114 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 ATOH7Q8N100 152 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 M0R2N4 97 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 C5orf38Q86SI9 138 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 LINC00310P59036 64 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 C14orf177Q52M58 125 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 CASC10Q5T4H9 136 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LINC01545Q5VT33 79 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 TSTD3H0UI37 97 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 UBE2D1P51668 147 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 LINC00587B1AMM8 73 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 IGLC3P0DOY3 106 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 C12orf57Q99622 126 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 SPAG11BQ08648 103 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 UBE2V1Q13404 147 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 STPG4Q8N801 248 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 DPH3Q96FX2 82 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 hDV102S1A0JD36 115 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF815PA8K554 130 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LEPROTO15243 131 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 SFTA2Q6UW10 78 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 COX7B2Q8TF08 81 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 COPS9Q8WXC6 57 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 CXCL5P42830 114 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 C6orf223Q8N319 242 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 Q8N3U1 123 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 J3QQQ9 107 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRO-210ENST00000544244 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 LINC00158P58513 81 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 ENHOQ6UWT2 76 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRO-210ENST00000544244 C9orf118A6NHY6 69 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 PYY3Q5JQD4 70 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 A0A087WZ39 114 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM223A0PJW6 202 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 HERV-K104P63124 156 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 PRO1933Q9H354 126 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 PRR34Q9NV39 138 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 E9PLD3 99 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 C14orf144Q96I85 54 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 COX6A2Q02221 97 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
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