RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.21□□□□□ -1.58
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
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SEC31A-241ENST00000515749 TAL2Q16559 108 aa5.21□□□□□ -1.58
SEC31A-241ENST00000515749 LELP1Q5T871 98 aa5.21□□□□□ -1.58
SEC31A-241ENST00000515749 PCP2Q8IVA1 136 aa5.21□□□□□ -1.58
SEC31A-241ENST00000515749 RETNQ9HD89 108 aa5.21□□□□□ -1.58
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SEC31A-241ENST00000515749 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.2□□□□□ -1.58
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SEC31A-241ENST00000515749 ZNF815PA8K554 130 aa5.18□□□□□ -1.58
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SEC31A-241ENST00000515749 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.17□□□□□ -1.58
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SEC31A-241ENST00000515749 CEND1Q8N111 149 aa5.15□□□□□ -1.59
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SEC31A-241ENST00000515749 TIMM17BO60830 172 aa5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 HERV-K104P63124 156 aa5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 REG3AQ06141 175 aa5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.14□□□□□ -1.59
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SEC31A-241ENST00000515749 PRR34Q9NV39 138 aa5.14□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 COL7A1Q02388 2944 aa5.13□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.13□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 A0A0J9YXY3 114 aa5.13□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 GCSHP23434 173 aa5.13□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 PTTG1IPP53801 180 aa5.13□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 ESRGQ1W209 222 aa5.13□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.12□□□□□ -1.59
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SEC31A-241ENST00000515749 SMIM13P0DJ93 91 aa5.12□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 CCL18P55774 89 aa5.12□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 MIAQ16674 131 aa5.12□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.12□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 COX7A2LO14548 114 aa5.11□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 APOMO95445 188 aa5.11□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-30P01768 117 aa5.11□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 CRPP02741 224 aa5.11□□□□□ -1.59
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.11□□□□□ -1.59
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