RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCYAP1P18509 176 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 SPAG11BQ08648 103 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf48Q96LS8 159 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP4-211ENST00000493436 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.52□□□□□ -0.72
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SH3BP4-211ENST00000493436 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10.51□□□□□ -0.73
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SH3BP4-211ENST00000493436 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.51□□□□□ -0.73
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SH3BP4-211ENST00000493436 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.49□□□□□ -0.73
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SH3BP4-211ENST00000493436 SEC11CQ9BY50 192 aa10.48□□□□□ -0.73
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SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0J9YXV3 536 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-211ENST00000493436 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.47□□□□□ -0.73
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SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZN92 141 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 S100PP25815 95 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2D1P51668 147 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 AMELXQ99217 191 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 VCX2Q9H322 139 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PNN7 141 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 C10orf25Q5T742 122 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.43□□□□□ -0.74
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SH3BP4-211ENST00000493436 G0S2P27469 103 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0087Q14695 138 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.41□□□□□ -0.74
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SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZRP5 223 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP4-211ENST00000493436 MT1HL1P0DM35 61 aa10.39□□□□□ -0.75
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SH3BP4-211ENST00000493436 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 TOMM6Q96B49 74 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 TIMM17AQ99595 171 aa10.39□□□□□ -0.75
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SH3BP4-211ENST00000493436 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 RHEBQ15382 184 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf82Q6UX34 121 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP4-211ENST00000493436 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 MT-ND6P03923 174 aa10.35□□□□□ -0.75
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SH3BP4-211ENST00000493436 HERVK_113P63121 156 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC11AP67812 179 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.35□□□□□ -0.75
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SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01546A6NGU7 62 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM168BA1KXE4 195 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-211ENST00000493436 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-211ENST00000493436 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-211ENST00000493436 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01549A6NIU2 74 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-211ENST00000493436 CKS1BP61024 79 aa10.32□□□□□ -0.76
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