RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A0G2JND7	137 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	GYPA	P02724	150 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ASIP	P42127	132 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PKIA	P61925	76 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SERP2	Q8N6R1	65 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		Q9H521	79 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MAST4	O15021	2626 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MED13L	Q71F56	2210 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SPEF2	Q9C093	1822 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	F8	P00451	2351 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		H0Y9P7	68 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PI4KA	P42356	2102 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ETDB	Q3ZM63	59 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ABCC5	O15440	1437 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	HMGXB3	Q12766	1538 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ABCC2	Q92887	1545 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	LRP6	O75581	1613 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MYH6	P13533	1939 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1B0GU69	56 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		D6R8Y8	96 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		I3L2K1	104 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MT-ATP8	P03928	68 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SPRR1A	P35321	89 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CRIPT	Q9P021	101 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	IFT172	Q9UG01	1749 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PHLPP1	O60346	1717 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A087WVE0	104 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		H7BZZ5	65 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		I3L3M4	83 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	LEPROTL1	O95214	131 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	LCN9	Q8WX39	176 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		V9GYS6	101 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MYOM1	P52179	1685 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	IGF2R	P11717	2491 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FLNC	Q14315	2725 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ZFHX3	Q15911	3703 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TENM4	Q6N022	2769 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ADGRL2	O95490	1459 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		0.15	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PARP14	Q460N5	1801 aa		0.15	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.15	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	CYB5A	P00167	134 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	SPRR1B	P22528	89 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	PEA15	Q15121	130 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	PRDM2	Q13029	1718 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CCNL1-223	ENST00000481173	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.15	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.3 ms