RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.09□□□□□ -2.07
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ECHDC1-211ENST00000460558 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 COX7A2LO14548 114 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 STAG3L2P0CL84 134 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM17P0DL12 118 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL12P30050 165 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
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ECHDC1-211ENST00000460558 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 LCE1EQ5T753 118 aa2.09□□□□□ -2.07
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ECHDC1-211ENST00000460558 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 AP3S1Q92572 193 aa2.09□□□□□ -2.07
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
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ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf66A4D0T2 115 aa2.08□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM25GB3EWG6 89 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 KRBOX1C9JBD0 128 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFA1O15239 70 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A20O43772 301 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 HPGDSO60760 199 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 HSBP1O75506 76 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 CST7O76096 145 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 S100A9P06702 114 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 PMCHP20382 165 aa2.08□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R45P59539 299 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 SPAG11BQ08648 103 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM241Q24JQ0 296 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 BTF3L4Q96K17 158 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.08□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.08□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 G3V3Q6 166 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 M0QY20 66 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 SFT2D2O95562 160 aa2.07□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 TCRAP04437 139 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB5AP20339 215 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 S100A11P31949 105 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 TGFBR1P36897 503 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 HBG1P69891 147 aa2.07□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R1AQ13522 171 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 C5orf17Q8NAS9 161 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.07□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 MCUBQ9NWR8 336 aa2.07□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPXA8MT69 81 aa2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 MGPP08493 103 aa2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 AP1S3Q96PC3 154 aa2.06□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 C22orf24Q9Y442 160 aa2.06□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 SH2D1AO60880 128 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5AL1P0C617 328 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 NTF3P20783 257 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 SULT1A1P50225 295 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V1FQ16864 119 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 STX12Q86Y82 276 aa2.05□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 NIT2Q9NQR4 276 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa2.05□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.04□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.04□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 NCR2O95944 276 aa2.04□□□□□ -2.08
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ECHDC1-211ENST00000460558 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
ECHDC1-211ENST00000460558 VAMP3Q15836 100 aa2.04□□□□□ -2.08
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