RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 CCL25O15444 150 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB130BP0DP73 79 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB130AP0DP74 79 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 FABP2P12104 132 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 A8MZ25 164 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 RNF183Q96D59 192 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 NACAE9PAV3 2078 aa7.04□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 K7EP34 96 aa7.03□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-204ENST00000424089 RAB37Q96AX2 223 aa7.03□□□□□ -1.28
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POLR1A-204ENST00000424089 IGLL5B9A064 214 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 K7EP13 123 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB135Q30KP9 77 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.02□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.01□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 PAX4O43316 350 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 GYPEP15421 78 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 DAD1P61803 113 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SPATA25Q9BR10 227 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 ATP5G1P05496 136 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SPINK8P0C7L1 97 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 IFITM1P13164 125 aa7□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 LYRM7Q5U5X0 104 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf126Q8N4M7 172 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 Q8NAQ8 132 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 COPS9Q8WXC6 57 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SPANXDQ9BXN6 97 aa7□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.99□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 K7ERJ3 54 aa6.99□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0B4J2C4 111 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 COX6A2Q02221 97 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 GAGE6Q13070 117 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SFTA2Q6UW10 78 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 F5H768 121 aa6.97□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 MIAQ16674 131 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 LITAFQ99732 161 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-204ENST00000424089 HERC2O95714 4834 aa6.97□□□□□ -1.29
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POLR1A-204ENST00000424089 CFC1P0CG37 223 aa6.96□□□□□ -1.3
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POLR1A-204ENST00000424089 A4D1N5 150 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 F8W1H4 67 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 H3BNG1 76 aa6.95□□□□□ -1.3
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POLR1A-204ENST00000424089 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087WZ39 114 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM262E9PQX1 116 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 APOMO95445 188 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS2P07478 247 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 RBX1P62877 108 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 Q9H8V8 135 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 RYR1P21817 5038 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 TSPAN13O95857 204 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 ERG28Q9UKR5 140 aa6.93□□□□□ -1.3
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