RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	USH2A	O75445	5202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF861P	O60384	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB5A	P20339	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	COTL1	Q14019	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PRE2	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	LTA	P01374	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	NTF3	P20783	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2B	P63146	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	COLCA2	A8K830	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0QXV9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSHB	P01222	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	SS18	Q15532	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CXorf1	O96002	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFNA1	P01562	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFA6	P56556	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2G1	P62253	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651		H0Y8G0	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CXCL1	P09341	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEBPG	P53567	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NIF3L1-206	ENST00000416651	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651		F8WDY8	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPREB1	P12018	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB4A	P20338	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKR1C3	P42330	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	COX7A2L	O14548	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ESD	P10768	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	APCS	P02743	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDT	P30046	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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