RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 CTAG1AP78358 180 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 SS18Q15532 418 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 TAL2Q16559 108 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 PCP2Q8IVA1 136 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 J3QQQ9 107 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 MPV17L2Q567V2 206 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF815PA8K554 130 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 HSD52Q0P140 79 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 SFTA2Q6UW10 78 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WZ39 114 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TCTAP57738 103 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 COX6A2Q02221 97 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 LYSTQ99698 3801 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 PRR34Q9NV39 138 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 K7EP13 123 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 REG3AQ06141 175 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 ESRGQ1W209 222 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CCL18P55774 89 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 HERV-K104P63124 156 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 UPK3BQ9BT76 320 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFA1O15239 70 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM17BO60830 172 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 SPINK8P0C7L1 97 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZVH6 145 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 NUPR2A6NF83 97 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 GCSHP23434 173 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 MIAQ16674 131 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TM2D2Q9BX73 214 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0J9YXY3 114 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 A6NDN8 102 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 IGLL5B9A064 214 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM238C9JI98 176 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CRPP02741 224 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 KLK12Q9UKR0 248 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1A-202ENST00000409024 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 A6NJY4 79 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 COX7A2LO14548 114 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 EREGO14944 169 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 APOMO95445 188 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL5P42830 114 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 ENHOQ6UWT2 76 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 Q8IZM0 81 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 CEND1Q8N111 149 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 COX7B2Q8TF08 81 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 COPS9Q8WXC6 57 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H4GQ99525 98 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IFITM1P13164 125 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 XCL1P47992 114 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 SPANXCQ9NY87 97 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-30P01768 117 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-33P01772 117 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.62□□□□□ -1.35
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