RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSLPQ969D9 159 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPH3Q96FX2 82 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC167Q9P0B6 97 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 FDCSPQ8NFU4 85 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 COPS9Q8WXC6 57 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 COPZ2Q9P299 210 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAIMQ9NVQ4 179 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPTBN4Q9H254 2564 aa-1.85□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 PYDC1Q8WXC3 89 aa-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-1.86□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIVEP1P15822 2718 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFTRP13569 1480 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 B2MP61769 119 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTAF1O14981 1849 aa-1.87□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.88□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKD1P98161 4303 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLC1P0CG04 106 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC01600Q96MT4 127 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERP1Q9Y6X1 66 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-1.89□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKAP14Q86UN6 197 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPRR4Q96PI1 79 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRIN2AQ12879 1464 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYOM1P52179 1685 aa-1.9□□□□□ -2.71
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 RERGLQ9H628 205 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SONP18583 2426 aaKnown RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAT3Q8TDW7 4589 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM21Q3B7S5 101 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUC17Q685J3 4493 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSME4Q14997 1843 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSSCA1O60232 199 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRO1933Q9H354 126 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARPC4P59998 168 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PFDN5Q99471 154 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPANXDQ9BXN6 97 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 UQCR10Q9UDW1 63 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP152O94986 1710 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCN9Q8WX39 176 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPG11Q96JI7 2443 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TACC2O95359 2948 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.97□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 TET3O43151 1660 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 DR1Q01658 176 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC11AP67812 179 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFHX3Q15911 3703 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 H0YGG7 62 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRIPTQ9P021 101 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBASA2RRP1 2371 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAH3Q8TD57 4116 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CATR1Q13166 79 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q56UQ5 140 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 C5orf38Q86SI9 138 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL11Q969Q4 196 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00474Q9P2X8 69 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITPR3Q14573 2671 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 HTTP42858 3142 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLIT1O75093 1534 aa-2.01□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM25AB3EWG3 89 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM25CB3EWG5 89 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM25GB3EWG6 89 aa-2.02□□□□□ -2.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 I3L3M4 83 aa-2.02□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.1 ms