RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.43□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 FHL2Q14192 279 aa9.43□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 A0A0J9YXY3 114 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 XCL1P47992 114 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 AMELXQ99217 191 aa9.42□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 MIFP14174 115 aa9.41□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 A0A0J9YWU9 116 aa9.41□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.41□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 A0A1B0GWB2 263 aa9.41□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 HERVK_113P63121 156 aa9.41□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.4□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 K7ERU9 68 aa9.4□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 UBE2D1P51668 147 aa9.4□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.4□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.4□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 ERG28Q9UKR5 140 aa9.4□□□□□ -0.9
HCN3-201ENST00000368358 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 ETDBQ3ZM63 59 aa9.4□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.4□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.4□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 RNF183Q96D59 192 aa9.4□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 WFDC2Q14508 124 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 LYRM9A8MSI8 78 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-30P01768 117 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 PFN2P35080 140 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.39□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 CFC1BP0CG36 223 aa9.38□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 CFC1P0CG37 223 aa9.38□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZTC4 211 aa9.38□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.38□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 PTH2Q96A98 100 aa9.38□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 TSPAN13O95857 204 aa9.37□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 LINC00158P58513 81 aa9.37□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.37□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.37□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 CIDEAO60543 219 aa9.36□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 CRYBA4P53673 196 aa9.36□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 FAM104AQ969W3 186 aa9.36□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.36□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-33P01772 117 aa9.36□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 Q8NAQ8 132 aa9.36□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.35□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 IL17DQ8TAD2 202 aa9.35□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.35□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.34□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 Q8N3U1 123 aa9.34□□□□□ -0.91
HCN3-201ENST00000368358 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.33□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.33□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.33□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.33□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.32□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 MALP21145 153 aa9.32□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 RBX1P62877 108 aa9.32□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 SS18Q15532 418 aa9.32□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.32□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 KLK12Q9UKR0 248 aa9.32□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 C9JAW5 83 aa9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 TIRAPP58753 221 aa9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 UBE2WQ96B02 151 aa9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 COX6CP09669 75 aa9.3□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 TCL1BO95988 128 aa9.3□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 K7EIL1 84 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 CRPP02741 224 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 MIAQ16674 131 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 COX7B2Q8TF08 81 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 SPATA25Q9BR10 227 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 Q9HAA7 133 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 J3QR89 54 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 CKS1BP61024 79 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.29□□□□□ -0.92
HCN3-201ENST00000368358 C2orf82Q6UX34 121 aa9.27□□□□□ -0.93
HCN3-201ENST00000368358 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.27□□□□□ -0.93
HCN3-201ENST00000368358 F8W1H4 67 aa9.27□□□□□ -0.93
HCN3-201ENST00000368358 NDUFA1O15239 70 aa9.27□□□□□ -0.93
HCN3-201ENST00000368358 CLEC2BQ92478 149 aa9.27□□□□□ -0.93
HCN3-201ENST00000368358 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.26□□□□□ -0.93
HCN3-201ENST00000368358 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.9 ms