RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 RBX1P62877 108 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 ARL17AQ8IVW1 177 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 MIAQ16674 131 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 A0A0B4J2C4 111 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 Q9H8V8 135 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 TIMM17BO60830 172 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX18-201ENST00000326277 Q8NAQ8 132 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 F8W1H4 67 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 PAX4O43316 350 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 NPC2P61916 151 aa15.95■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3-33P01772 117 aa15.94■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 A0A096LPF7 62 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 K7ERU9 68 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 MIFP14174 115 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 WFDC2Q14508 124 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 DAND5Q8N907 189 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 CELA1Q9UNI1 258 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 DAD1P61803 113 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 RNF151Q2KHN1 245 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 MTURNQ8N3F0 131 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 PSMB2P49721 201 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 RNF183Q96D59 192 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 PRO0461Q9UI25 63 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 LYRM7Q5U5X0 104 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 ERG28Q9UKR5 140 aa15.91■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 H7C2G1 150 aa15.9■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.9■□□□□ 0.14
SNX18-201ENST00000326277 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.89■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 TMEM262E9PQX1 116 aa15.88■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 IFITM1P13164 125 aa15.88■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.87■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 TCL1BO95988 128 aa15.87■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 A0A0U1RRA0 63 aa15.87■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 SCGB1C2P0DMR2 95 aa15.87■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 A0A1B0GUV1 79 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 ATP5G1P05496 136 aa15.86■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 SPART-AS1P0CW21 52 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP10-11P60412 298 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 Q1RN00 199 aa15.85■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 HERV-K104P63124 156 aa15.84■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 G3V4G9 280 aa15.83■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.83■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.83■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 COX7B2Q8TF08 81 aa15.83■□□□□ 0.13
SNX18-201ENST00000326277 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.83■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 ETDBQ3ZM63 59 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 SH2D6Q7Z4S9 175 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 A0A087WZ39 114 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.82■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 C5orf38Q86SI9 138 aa15.81■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 VPS25Q9BRG1 176 aa15.81■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 HTN3P15516 51 aa15.8■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 C3orf56Q8N813 242 aa15.8■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.79■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.79■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.78■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 TRIAP1O43715 76 aa15.77■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 XCL1P47992 114 aa15.77■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 SS18Q15532 418 aa15.77■□□□□ 0.12
SNX18-201ENST00000326277 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.76■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.75■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 Q8N3U1 123 aa15.75■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 COPS9Q8WXC6 57 aa15.75■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 RETNQ9HD89 108 aa15.75■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 SHISA2Q6UWI4 295 aa15.74■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.74■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 STAB1Q9NY15 2570 aa15.73■□□□□ 0.11
SNX18-201ENST00000326277 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa15.7■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 ATXN8Q156A1 80 aa15.69■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.69■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.69■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 C9JAW5 83 aa15.68■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 LELP1Q5T871 98 aa15.68■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 REG3AQ06141 175 aa15.67■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.67■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 COX6CP09669 75 aa15.67■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 LINC00158P58513 81 aa15.67■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.66■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.66■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 J3QR89 54 aa15.66■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 SLC25A20O43772 301 aa15.66■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.66■□□□□ 0.1
SNX18-201ENST00000326277 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms