RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0B4J2C4 111 aa11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 WIPF1O43516 503 aa11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2G2AP14555 144 aa11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf82Q6UX34 121 aa11.69□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 DAND5Q8N907 189 aa11.68□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.68□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 F5H768 121 aa11.67□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 ATXN8Q156A1 80 aa11.67□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 K7EQD1 137 aa11.67□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.66□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.65□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.65□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.65□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 TIRAPP58753 221 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 MIAQ16674 131 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 SPANXCQ9NY87 97 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.64□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 UQCRQO14949 82 aa11.63□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 C4orf26Q17RF5 130 aa11.63□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.63□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.63□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0U1RRA0 63 aa11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 TRIAP1O43715 76 aa11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV1-51P01701 117 aa11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf95Q9H693 158 aa11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.62□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 H7C423 109 aa11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 SMR3AQ99954 134 aa11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 Q9H8V8 135 aa11.61□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 hADV29S1A0JD25 119 aa11.6□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFA1O15239 70 aa11.6□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.6□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.6□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.6□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GX51 115 aa11.59□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.59□□□□□ -0.55
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.58□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.58□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf74Q96GX8 76 aa11.58□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.58□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 CLEC2BQ92478 149 aa11.58□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.57□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 HIVEP2P31629 2446 aa11.57□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 TIMM17BO60830 172 aa11.56□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 DSCR8Q96T75 97 aa11.56□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.56□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2L6O14933 153 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM243Q9BU79 118 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 HILS1P60008 231 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-3P60369 221 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.54□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.54□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 OXTP01178 125 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 COX7CP15954 63 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 VWFP04275 2813 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.53□□□□□ -0.56
SHQ1-201ENST00000325599 FHL2Q14192 279 aa11.52□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB130BP0DP73 79 aa11.51□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB130AP0DP74 79 aa11.51□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 DPH3Q96FX2 82 aa11.51□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 TRACP01848 142 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 NOTCH2Q04721 2471 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 H3BT86 120 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 J3QKU1 62 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 IMUPQ9GZP8 106 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 COX6CP09669 75 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms