RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 PAX4O43316 350 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 HERVK_113P63121 156 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC179H3BU77 68 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 K7EQD1 137 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 IFITM1P13164 125 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 XCL1P47992 114 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM243Q9BU79 118 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 HTN3P15516 51 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 SLPIP03973 132 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 DNAL4O96015 105 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 LST1O00453 97 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFA1O15239 70 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 SPANXCQ9NY87 97 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 CRPP02741 224 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 VWFP04275 2813 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 A0A096LNT2 108 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 CR1P17927 2039 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 AKAP9Q99996 3911 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 TIRAPP58753 221 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD1-201ENST00000259365 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 SMR3AQ99954 134 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 COX7B2Q8TF08 81 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 H3BT86 120 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 PF4P02776 101 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 COX7A2LO14548 114 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 GYPEP15421 78 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 CITED1Q99966 193 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 LECT2O14960 151 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF843Q8N446 348 aa9.49□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 HIVEP1P15822 2718 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 LINC01006Q8NI28 216 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 F8P00451 2351 aa9.48□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WYN8 130 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 Q8N3U1 123 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD1-201ENST00000259365 NCR3O14931 201 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 RNF152Q8N8N0 203 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 COPS9Q8WXC6 57 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 TENM4Q6N022 2769 aa9.46□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 CCL18P55774 89 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.45□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 F5H768 121 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 TIMM17BO60830 172 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 FSHBP01225 129 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 C16orf74Q96GX8 76 aa9.44□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 MALP21145 153 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB135Q30KP9 77 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 PDZD2O15018 2839 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 HERV-K104P63124 156 aa9.43□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.42□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.5 ms