RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GXF2	115 aa		10.77	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035		D6R8Y8	96 aa		10.77	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SS18	Q15532	418 aa		10.77	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.77	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		10.76	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.76	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		10.76	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.76	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPG2	P98160	4391 aa		10.76	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHOX2A	O14813	284 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	XCL1	P47992	114 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFITM2	Q01629	132 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ORMDL3	Q8N138	153 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.75	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCL25	O15444	150 aa		10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPY	P01303	97 aa		10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB5A	P20339	215 aa		10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		10.73	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.72	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.72	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		10.72	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.71	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXI1	Q12951	378 aa		10.71	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.71	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.71	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		10.71	□□□□□ -0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.7	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.7	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.7	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		10.7	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	COMMD7	Q86VX2	200 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		10.69	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.68	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAL	P21145	153 aa		10.68	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.68	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.67	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLPI	P03973	132 aa		10.67	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.67	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		10.67	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.66	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	S100P	P25815	95 aa		10.66	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZUT4	128 aa		10.66	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX7A2L	O14548	114 aa		10.65	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS47	A8MTI9	375 aa		10.64	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.63	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOM	O95445	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		10.63	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX6A2	Q02221	97 aa		10.62	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q8N8P6	123 aa		10.62	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		10.61	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		10.61	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	C5orf38	Q86SI9	138 aa		10.61	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		10.61	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10.6	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CARD19	Q96LW7	228 aa		10.6	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		10.6	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PANO1	I0J062	215 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035		K7EMI3	77 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	G0S2	P27469	103 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.59	□□□□□ -0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WYN8	130 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHEB	Q15382	184 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX19	Q49B96	90 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZN92	141 aa		10.58	□□□□□ -0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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