RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	AGRN	O00468	2067 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	CRYGD	P07320	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	AZU1	P20160	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	AKR1D1	P51857	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NCR2	O95944	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NPY	P01303	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00315	P59091	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NIT1	Q86X76	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		Q8N8P6	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		V9GYY9	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0J9YXY3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		M0QY20	66 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	FABP4	P15090	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	MUC4	Q99102	2169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	HBD	P02042	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	SORL1	Q92673	2214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	FCER1G	P30273	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	RHOH	Q15669	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6ZTI0	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		Q8NAQ8	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	C20orf202	A1L168	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		I3L3M4	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NUPR1	O60356	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	PRM2	P04554	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	DAD1	P61803	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139		Q9UF83	564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP5G1	P05496	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	MT3	P25713	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CNOT1-222	ENST00000570139	EMP1	P54849	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms