RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCA4P78363 2273 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 RPL39P62891 51 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZSV7 163 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LY75O60449 1722 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 A8MUN3 132 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 CDSNQ15517 529 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa2.26□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 PLA2G2CQ5R387 149 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00167Q96N53 147 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TNP2Q05952 138 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 PHIPQ8WWQ0 1821 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 K7EIM0 57 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB132Q7Z7B7 95 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB136Q30KP8 78 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SPATA3Q8NHX4 192 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ODF3BA8MYP8 253 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SIPA1L1O43166 1804 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM104AQ969W3 186 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 A8MWP4 228 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 G3V318 75 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 NCOR2Q9Y618 2525 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 Q96NJ1 140 aa2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIP11Q15643 1979 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 OCR1Q9BZK8 76 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZRP5 223 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD36A6QL64 1941 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 WIPF1O43516 503 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LYNX1G3V0Z9 82 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LYNX1P0DP58 116 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 CYYR1Q96J86 154 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 NINQ8N4C6 2090 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF236Q9UL36 1845 aa2.23□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 DOCK5Q9H7D0 1870 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 PSME4Q14997 1843 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 FOCADQ5VW36 1801 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TAF1LQ8IZX4 1826 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TTC28Q96AY4 2481 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ROMO1P60602 79 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 KLKP1Q107X0 134 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00846Q9NV44 126 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 COL18A1P39060 1754 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 IGLV1-40P01703 118 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF575Q86XF7 245 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 ECM29Q5VYK3 1845 aa2.22□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 C16orf90A8MZG2 172 aa2.21□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 SCN1AP35498 2009 aa2.21□□□□□ -2.05
JMJD1C-210ENST00000542921 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 MYO9BQ13459 2157 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 PP632Q6XCG6 107 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 CACNA1CQ13936 2221 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PNM2 257 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 I3L2K1 104 aa2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 WT1-ASQ06250 92 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZTI0 123 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 INAFM1C9JVW0 142 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PNN7 141 aa2.2□□□□□ -2.06
JMJD1C-210ENST00000542921 P0C880 135 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms