RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528216.5

PGAP2-231, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 1 (best)

Gene PGAP2, Length 1,815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-231	ENST00000528216	MDFI	Q99750	246 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		F8W1H4	67 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		K7ERJ3	54 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IGHV3-30	P01768	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	UBE2D3	P61077	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	UBE2D2	P62837	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	FAM104A	Q969W3	186 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	RNF183	Q96D59	192 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TIMM17B	O60830	172 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	PRM2	P04554	102 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	HERVK_113	P63121	156 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		Q6ZTI0	123 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	COL6A5	A8TX70	2615 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		A0A0J9YXY3	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		Q6ZUT4	128 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	FBN3	Q75N90	2809 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		A0A0B4J2C4	111 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	COPS9	Q8WXC6	57 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	SPANXC	Q9NY87	97 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IFITM1	P13164	125 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	RBX1	P62877	108 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	C3orf56	Q8N813	242 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216		Q9UF83	564 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PGAP2-231	ENST00000528216	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216		J3QR89	54 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	UBE2L6	O14933	153 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	DNHD1	Q96M86	4753 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	NDUFA1	O15239	70 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE7	O76087	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	TSPAN13	O95857	204 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	CFC1	P0CG37	223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE12F	P0CL80	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE12G	P0CL81	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE12I	P0CL82	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	APOM	O95445	188 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE4	Q13068	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	GAGE5	Q13069	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	KRTAP10-3	P60369	221 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	MIA	Q16674	131 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216		A4D1N5	150 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216		G3V4G9	280 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	APOC4	P55056	127 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	HERV-K104	P63124	156 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	FHL2	Q14192	279 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	LYRM9	A8MSI8	78 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	LITAF	Q99732	161 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216		H3BMG7	143 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216		M0QXV9	152 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PGAP2-231	ENST00000528216	IGHV3-33	P01772	117 aa		7.23	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms