RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPRMQ9NS64 109 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 SSR3Q9UNL2 185 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 PATJQ8NI35 1801 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADCY9O60503 1353 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 LIN52Q52LA3 116 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q6AWC8 147 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 AKAP14Q86UN6 197 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 STOML2Q9UJZ1 356 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRNDQ9UKY0 176 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERICH2A1L162 156 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP1R17O96001 155 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 HSD11B1P28845 292 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 B2MP61769 119 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 SELENOSQ9BQE4 189 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF236Q9UL36 1845 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A087WVE0 104 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 YPEL1O60688 119 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 APOC3P02656 99 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 GNG5P63218 68 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 C10orf82Q8WW14 230 aa-3.78□□□□□ -3.01
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRDM2Q13029 1718 aa-3.78□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 GABARAPH6UMI1 98 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 I3L3M4 83 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 J3QLW9 94 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 UQCR11O14957 56 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 CRYBA4P53673 196 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPPP2P59282 170 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 STX19Q8N4C7 294 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 CRIPTQ9P021 101 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCL22O00626 93 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 BAGE2Q86Y30 109 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 STX12Q86Y82 276 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 WFDC13Q8IUB5 93 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 DEFB4AO15263 64 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 MUC3AQ02505 3323 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGEF5Q12774 1597 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCORQ6W2J9 1755 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 HEPN1Q6WQI6 88 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 V9GYH0 126 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 A6NIN4 97 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 CETN3O15182 167 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 WFDC9Q8NEX5 89 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 RBP4P02753 201 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSN2P05814 226 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGF7P21781 194 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMED4Q7Z7H5 227 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMIM23A6NLE4 172 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 CST2P09228 141 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 LTC4SQ16873 150 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC01545Q5VT33 79 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 CBLN4Q9NTU7 201 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 HIGD1BQ9P298 99 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 LENEPQ9Y5L5 61 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 A2MP01023 1474 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q6ZUT4 128 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC42Q96M95 316 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 DAPK1P53355 1430 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSPHP78330 225 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCL8P80075 99 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPA17Q15506 151 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 C9orf16Q9BUW7 83 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYH8P13535 1937 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 H7BZZ5 65 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 M0QZK8 103 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPM1P09493 284 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-162P-201ENST00000516228 S100A11P31949 105 aa-3.88□□□□□ -3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms