RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 MUC4Q99102 2169 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.98□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PPR1 153 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 LYRM9A8MSI8 78 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.96□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.96□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.96□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.96□□□□□ -0.81
HDLBP-241ENST00000487169 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.822e-7■■□□□ 14.1
HDLBP-241ENST00000487169 HILS1P60008 231 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01620Q4KN68 170 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 LECT2O14960 151 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 USP34Q70CQ2 3546 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 REG3AQ06141 175 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 AGRNO00468 2067 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 NCR3O14931 201 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 PLA2G2AP14555 144 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 M0QY20 66 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV1-40P01703 118 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 MIFP14174 115 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV2-11P01706 119 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 TRACP01848 142 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 PROK1P58294 105 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 WFDC2Q14508 124 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 IL17DQ8TAD2 202 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2AP49459 152 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 G3V4G9 280 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 SMR3AQ99954 134 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 CENPEQ02224 2701 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 DIRC1Q969H9 104 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA25Q9BR10 227 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 TEN1Q86WV5 123 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.9□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 PRM2P04554 102 aa9.9□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.9□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC2BQ92478 149 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 PRR9Q5T870 116 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0J9YXY3 114 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFS5O43920 106 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 DCANP1Q8TF63 244 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 KLLNB2CW77 178 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 CITED1Q99966 193 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 NFE4Q86UQ8 179 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 RNF185Q96GF1 192 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 CRYGDP07320 174 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 SPANXCQ9NY87 97 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 MIAQ16674 131 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 ACYP1P07311 99 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 NREPQ16612 68 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 RNF183Q96D59 192 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 H3BT86 120 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 C14orf177Q52M58 125 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-241ENST00000487169 PTH2Q96A98 100 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFB1O75438 58 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 ADAMTS20P59510 1910 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 FRYLO94915 3013 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 H7C423 109 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 COX7BP24311 80 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-241ENST00000487169 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.2 ms