RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C18orf65Q6ZTR6 163 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N976 141 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AVPP01185 164 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00310P59036 64 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.34□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MZ25 164 aa12.34□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF843Q8N446 348 aa12.34□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0C4DFX4 3053 aa12.34□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMB8P28062 276 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PPR1 153 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8P00451 2351 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA1O15239 70 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.33□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8W735 103 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIAQ16674 131 aa12.32□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ODF3Q96PU9 254 aa12.32□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INAFM1C9JVW0 142 aa12.31□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRACQ8N912 160 aa12.31□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EDN2P20800 178 aa12.31□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.31□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 G3V4G9 280 aa12.3□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.3□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TM2D2Q9BX73 214 aa12.3□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U3KQK5 164 aa12.3□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRANK1O15050 2925 aa12.3□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFS5O43920 106 aa12.3□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.29□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.29□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BT86 120 aa12.28□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.28□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPEQ02224 2701 aa12.27□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MP68P56378 58 aa12.27□□□□□ -0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INSL3P51460 131 aa12.27□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF702PQ9H963 129 aa12.27□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.27□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.26□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.26□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM223A0PJW6 202 aa12.26□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.25□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REG3AQ06141 175 aa12.25□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.25□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLLNB2CW77 178 aa12.25□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCANP1Q8TF63 244 aa12.25□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMA3Q16787 3333 aa12.24□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIRAPP58753 221 aa12.24□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01006Q8NI28 216 aa12.24□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYGDP07320 174 aa12.24□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NREPQ16612 68 aa12.24□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC4Q99102 2169 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CXCL5P42830 114 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-9P60411 292 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV1-40P01703 118 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SVIPQ8NHG7 77 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRCA2P51587 3418 aa12.23□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BPTFQ12830 3046 aa12.23□□□□□ -0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIRC1Q969H9 104 aa12.22□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.22□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSHBP01222 138 aa12.22□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRK1Q8WUW1 75 aa12.22□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.21□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.21□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.21□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa12.21□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIAP1O43715 76 aa12.21□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLPIP03973 132 aa12.21□□□□□ -0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.2□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.2□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00643Q86TS7 51 aa12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT-ATP8P03928 68 aa12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATRQ13535 2644 aa12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF183Q96D59 192 aa12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGRNO00468 2067 aa12.19□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HECTD1Q9ULT8 2610 aa12.18□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BQ85 93 aa12.18□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNFNQ9BYD5 112 aa12.18□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFB1O75438 58 aa12.17□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP54Q96N23 3096 aa12.17□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBX1P62877 108 aa12.17□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCSK5Q92824 1860 aa12.17□□□□□ -0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf85Q96MD7 179 aa12.16□□□□□ -0.46
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