RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 F8W1H4 67 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2D3P61077 147 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2D2P62837 147 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM238C9JI98 176 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZTI0 123 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZUT4 128 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 H7C423 109 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 ANK2Q01484 3957 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0B4J2C4 111 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0J9YXY3 114 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 TSPAN13O95857 204 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 SPANXCQ9NY87 97 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 SORL1Q92673 2214 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 TIMM17BO60830 172 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 CFC1BP0CG36 223 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 CFC1P0CG37 223 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-3P60369 221 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 RNF183Q96D59 192 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 LITAFQ99732 161 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 G3V4G9 280 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 INSL3P51460 131 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 HERVK_113P63121 156 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 PRO0461Q9UI25 63 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00694P0DN24 101 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFA1O15239 70 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE13Q4V321 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 PF4P02776 101 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 A4D1N5 150 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 H3BMG7 143 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 APOMO95445 188 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 MIAQ16674 131 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-212ENST00000477970 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 IFITM1P13164 125 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM243Q9BU79 118 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 SPINK8P0C7L1 97 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 FHL2Q14192 279 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE12JA6NER3 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE7O76087 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-33P01772 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE12FP0CL80 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE12GP0CL81 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE12IP0CL82 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE4Q13068 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 GAGE5Q13069 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM101Q96IK0 257 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 M0QXV9 152 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 COX6A2Q02221 97 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 VPS25Q9BRG1 176 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC2Q14508 124 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 JMJD1CQ15652 2540 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-212ENST00000477970 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.62□□□□□ -1.03
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