RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 UBL5Q9BZL1 73 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 LITAFQ99732 161 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 SNURFQ9Y675 71 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFHX3Q15911 3703 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 SPG11Q96JI7 2443 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 GYPEP15421 78 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP10-9P60411 292 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 PATE1Q8WXA2 126 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-208ENST00000471759 MED12Q93074 2177 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 E7EQL1 145 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 TRGV3P03979 118 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ENHOQ6UWT2 76 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 F6UB75 175 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 F8W735 103 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 H3BRN7 92 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 VCYO14598 125 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 CD28P10747 220 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 C22orf24Q9Y442 160 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 TSHBP01222 138 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 WT1-ASQ06250 92 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 H0YGX0 51 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-48P01763 117 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 LCA10Q71F78 164 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF575Q86XF7 245 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 DSCAMO60469 2012 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 UBE2AP49459 152 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 LHBP01229 141 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A087WZ39 114 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 CCL13Q99616 98 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 Q6ZSV7 163 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 Q8N6K4 173 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 C19orf84I3L1E1 186 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV1-16P04430 117 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 C15orf32Q32M92 178 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A087WW49 117 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 MGPP08493 103 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 PRYO14603 147 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 MED14OSP0DP75 135 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 CXCL6P80162 114 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 Q8TAT8 98 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 Q9HAA7 133 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-208ENST00000471759 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-208ENST00000471759 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-208ENST00000471759 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.77□□□□□ -1.653e-10■■■□□ 16.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms