RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SNCGO76070 127 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 APOC2P02655 101 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 GYPAP02724 150 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 RBP4P02753 201 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CLPSP04118 112 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CTSGP08311 255 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FABP2P12104 132 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 COX7CP15954 63 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CBLN1P23435 193 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 HBBP68871 147 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 WFDC2Q14508 124 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ETDBQ3ZM63 59 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFL1Q6UW32 110 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TEN1Q86WV5 123 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB119Q8N690 84 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 DSCR8Q96T75 97 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID1AO14497 2285 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MED12LQ86YW9 2145 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 UMAD1C9J7I0 102 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF737O75373 536 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV6-57P01721 117 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DRB4P13762 266 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 DYNLT1P63172 113 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 PMCHL1Q16048 86 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NMSQ5H8A3 153 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 AQP3Q92482 292 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 RABAC1Q9UI14 185 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TACC2O95359 2948 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.57□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRPGP15A8MWD9 76 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 GNGT2O14610 69 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 GYPBP06028 91 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 Q9BRP9 147 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FN1P02751 2386 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NAP1L6A6NFF2 107 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD36A6QL64 1941 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ERJ3 54 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IL5P05113 134 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ATRQ13535 2644 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MPV17LQ2QL34 196 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 COMMD6Q7Z4G1 85 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 RTTNQ86VV8 2226 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N2B8 174 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF714Q96N38 554 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MCEEQ96PE7 176 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FXYD6Q9H0Q3 95 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.55□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC16AO15027 2179 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM24AA6NFZ4 105 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NUPR1O60356 82 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMM17BO60830 172 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NPC2P61916 151 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 NNATQ16517 81 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01545Q5VT33 79 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL26Q9Y258 94 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 KNL1Q8NG31 2342 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.54□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC168Q8NDH2 2452 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 POLEQ07864 2286 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PNN7 141 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 hADV29S1A0JD25 119 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SSSCA1O60232 199 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1I1O60431 355 aa2.53□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKCP01834 107 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms