RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 SPANXCQ9NY87 97 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 DCANP1Q8TF63 244 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.33□□□□□ -1.24
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TMOD3-201ENST00000308580 A8MZ25 164 aa7.31□□□□□ -1.24
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TMOD3-201ENST00000308580 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 TSHBP01222 138 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 EDN2P20800 178 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.31□□□□□ -1.24
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TMOD3-201ENST00000308580 CNFNQ9BYD5 112 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 KRTAP10-9P60411 292 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 C9orf85Q96MD7 179 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 NREPQ16612 68 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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TMOD3-201ENST00000308580 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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TMOD3-201ENST00000308580 A0A1B0GX51 115 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 LY6G6DO95868 133 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 H7C423 109 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 RBX1P62877 108 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-201ENST00000308580 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 COX7BP24311 80 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 TRIAP1O43715 76 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.27□□□□□ -1.25
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TMOD3-201ENST00000308580 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.25□□□□□ -1.25
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TMOD3-201ENST00000308580 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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TMOD3-201ENST00000308580 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 ACANP16112 2415 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 MT-ATP8P03928 68 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 IGIPA6NJ69 53 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.23□□□□□ -1.25
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TMOD3-201ENST00000308580 EML5Q05BV3 1969 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 SMR3AQ99954 134 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 CEP350Q5VT06 3117 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 PDE6GP18545 87 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD3-201ENST00000308580 C6orf99Q4VX62 202 aa7.22□□□□□ -1.25
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TMOD3-201ENST00000308580 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
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TMOD3-201ENST00000308580 UBE2D1P51668 147 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 UBE2D3P61077 147 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 UBE2D2P62837 147 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 TIMM17BO60830 172 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 SPATA25Q9BR10 227 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-201ENST00000308580 A0A096LNJ9 63 aa7.19□□□□□ -1.26
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