RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 GAGE12JA6NER3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 GAGE1Q13065 139 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 GAGE4Q13068 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 GAGE5Q13069 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 RHOHQ15669 191 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 GAGE13Q4V321 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 hDV102S1A0JD36 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 UPK3BQ9BT76 320 aa14.62□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 ERASQ7Z444 233 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 ODF1Q14990 250 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 Q6ZN92 141 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 IGIPA6NJ69 53 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 LINC01549A6NIU2 74 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 UBE2D3P61077 147 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 UBE2D2P62837 147 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 COTL1Q14019 142 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 BAALCQ8WXS3 180 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 IGLC3P0DOY3 106 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 A0A087WX48 190 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 TTC32Q5I0X7 151 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 C6orf223Q8N319 242 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 C14orf144Q96I85 54 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 TIMM17AQ99595 171 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 SIVA1O15304 175 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 TMEM141Q96I45 108 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 PKD1P98161 4303 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 IGKCP01834 107 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 DPM2O94777 84 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 STPG4Q8N801 248 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNE1-201ENST00000262643 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 F8VRH5 84 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 A0A1B0GVY2 172 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 FAM104AQ969W3 186 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 CST9LQ9H4G1 147 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 LINC00694P0DN24 101 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 PMVKQ15126 192 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 PLNP26678 52 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 TNP2Q05952 138 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 PKHD1P08F94 4074 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNE1-201ENST00000262643 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.45□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 VCX2Q9H322 139 aa14.45□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.44□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.44□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.44□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.43□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 TIRAPP58753 221 aa14.43□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 COX8AP10176 69 aa14.42□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 NMUP48645 174 aa14.42□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 TMEM243Q9BU79 118 aa14.42□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 FGF6P10767 208 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 CTAG1AP78358 180 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 Q6ZUT4 128 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 AMELXQ99217 191 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.41□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 C11orf86A6NJI1 115 aa14.4□□□□□ -0.1
CCNE1-201ENST00000262643 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.39□□□□□ -0.11
CCNE1-201ENST00000262643 LELP1Q5T871 98 aa14.39□□□□□ -0.11
CCNE1-201ENST00000262643 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.39□□□□□ -0.11
CCNE1-201ENST00000262643 UBE2L6O14933 153 aa14.39□□□□□ -0.11
CCNE1-201ENST00000262643 NPSP0C0P6 89 aa14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms