RNA–Protein interactions for RNA: YPL166W

ATG29, Transcript of Autophagy-specific protein, yeast

Gene ATG29, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG29	YPL166W	CBP3	P21560	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	AAD3	P25612	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	NIC96	P34077	839 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	GSM1	P42950	618 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	ASK10	P48361	1146 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	SAP4	P53036	818 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	PMA2	P19657	947 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	PTP1	P25044	335 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	YPT10	P38146	199 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG29	YPL166W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	STB5	P38699	743 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	GAT1	P43574	510 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	COS12	P53053	380 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	ADH4	P10127	382 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	NUP1	P20676	1076 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	MRPL9	P31334	269 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	XBP1	P40489	647 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	AAC1	P04710	309 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	SDH8	P38345	138 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	VFA1	P40080	203 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	LTP1	P40347	161 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	YFL015C	P43578	164 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	IDS2	P46958	469 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	TAX4	P47030	604 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	NET1	P47035	1189 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	CDC5	P32562	705 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	RPC34	P32910	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	YKL133C	P36066	463 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	YLF2	P38746	405 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	SWD1	P39706	426 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	IMA5	P40884	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	ACS1	Q01574	713 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	WAR1	Q03631	944 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	ENT2	Q05785	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	CRT10	Q08226	957 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	ARP7	Q12406	477 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	CTT1	P06115	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	OPT1	P40897	799 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	TRS31	Q03337	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
ATG29	YPL166W	APN1	P22936	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	HOT13	P36078	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	YJL043W	P47053	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	PIP2	P52960	996 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	MET14	Q02196	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	CRD1	Q07560	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG29	YPL166W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	EXO1	P39875	702 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	POL31	P46957	487 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	MLC2	Q06580	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	AAD4	Q07747	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	PCL8	Q08966	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	GAL1	P04385	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	LNP1	P38878	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	MAD3	P47074	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YNL092W	P53934	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	VPS64	Q03944	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	RGT2	Q12300	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	ATP4	P05626	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	MTG2	P38860	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	TEP1	P53916	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	NYV1	Q12255	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YCR061W	P25639	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	PTP2	P29461	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	GDA1	P32621	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	APD1	P38281	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	MAM1	P40065	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	LAS21	P40367	830 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	HIS6	P40545	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	TDA10	P42938	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	QRI7	P43122	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	COG2	P53271	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	CRF1	Q04930	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	ORM2	Q06144	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	AMD2	P22580	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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