RNA–Protein interactions for RNA: YMR274C

RCE1, Transcript of Type II CAAX prenyl protease, yeast

Gene RCE1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCE1	YMR274C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	YPR089W	O13585	888 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	ATP12	P22135	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	AEP2	P22136	580 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RCE1	YMR274C	PXL1	P36166	706 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YIL024C	P40543	189 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	MDR1	P53258	950 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	HER1	Q12276	1246 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	IRC7	P43623	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YJR142W	P47173	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YGR237C	P50089	785 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	ENT2	Q05785	613 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	DAL3	P32459	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	CDC5	P32562	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YEL076C	P39971	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	PEA2	P40091	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	CYK3	Q07533	885 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	CRT10	Q08226	957 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	MGM1	P32266	881 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	RAD33	Q04231	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	CWH43	P25618	953 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	CFD1	P40558	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	AIM44	Q99299	758 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	GDA1	P32621	518 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	FLO5	P38894	1075 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	IRC5	P43610	853 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YNL092W	P53934	400 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	SKY1	Q03656	742 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RCE1	YMR274C	RGT1	P32862	1170 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	SDH8	P38345	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	MTG2	P38860	518 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	YNL058C	P53947	316 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	RMP1	Q12530	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	VPS5	Q92331	675 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	CBP3	P21560	335 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	COQ3	P27680	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	ARG1	P22768	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	MAK32	P23060	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	LAS21	P40367	830 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	CIR1	P42940	261 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	COS12	P53053	380 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	COG2	P53271	262 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	NUP53	Q03790	475 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	FTH1	P38310	465 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	CIN1	P40987	1014 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	MNT2	P53059	558 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	UBP16	Q02863	499 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	YML119W	Q03208	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	HOS1	Q12214	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	GCS1	P35197	352 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	SPC105	P53148	917 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RCE1	YMR274C	URA3	P03962	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	AMD2	P22580	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	STB5	P38699	743 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	EAF5	P39995	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	MAM1	P40065	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	SNA4	Q07549	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	BUD7	Q08754	746 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	PLC1	P32383	869 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	SRL1	Q08673	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	ATO2	P32907	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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