RNA–Protein interactions for RNA: YLR079W

SIC1, Transcript of Cyclin-dependent kinase inhibitor (CKI), yeast

Gene SIC1, Length 855 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIC1	YLR079W	IDS2	P46958	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	YGL117W	P53133	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	AAD4	Q07747	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	AAC1	P04710	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	SDH8	P38345	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	TPM2	P40414	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	QRI7	P43122	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	YJR008W	P47085	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	GIS1	Q03833	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	VPS64	Q03944	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	HOF1	Q05080	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ENT2	Q05785	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ARO10	Q06408	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ULA1	Q12059	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	PHO81	P17442	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	MSH1	P25846	959 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	SAP4	P53036	818 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	COS12	P53053	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	TRS31	Q03337	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	CDC5	P32562	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	LNP1	P38878	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	LAS21	P40367	830 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	POL31	P46957	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	YNL058C	P53947	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	UBX4	P54730	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	PIF1	P07271	859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	PMA2	P19657	947 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	MRPL9	P31334	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	SWC3	P31376	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	PTH2	P34222	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	IMA5	P40884	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ARA2	Q04212	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	MSS18	P08593	268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	SIR1	P21691	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YPT10	P38146	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	APM3	P38153	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	MAM1	P40065	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	MAD3	P47074	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	ARG7	Q04728	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YCR061W	P25639	631 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YMC1	P32331	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	RPC34	P32910	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	APD1	P38281	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	STB5	P38699	743 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YHL041W	P38730	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	RTS3	P53289	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	FMP30	Q02883	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	AAD3	P25612	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	ATF1	P40353	525 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	CAB2	P40506	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	IMO32	P53219	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	ACS1	Q01574	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	ATG21	Q02887	496 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	WAR1	Q03631	944 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	COQ11	Q05892	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	AIM6	Q07716	390 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	POL3	P15436	1097 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	IRC3	Q06683	689 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	BNR1	P40450	1375 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	PDE1	P22434	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	ORC2	P32833	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	MRPL36	P36531	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	ACA1	P39970	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	IMA1	P53051	589 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	COG2	P53271	262 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	HIM1	Q06674	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	BIK1	P11709	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SIC1	YLR079W	TDA10	P42938	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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