RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570053.1

USP10-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 3

Gene USP10, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-218ENST00000570053 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.64□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 CYP26A1O43174 497 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 RXRBP28702 533 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 ARL4DP49703 201 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 PAOXQ6QHF9 649 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 XKR5Q6UX68 686 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 PIF1Q9H611 641 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.63□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 TRPA1O75762 1119 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 DRD2P14416 443 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 NFKBIBQ15653 356 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 PI16Q6UXB8 463 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.351e-7■□□□□ 9.6
USP10-218ENST00000570053 C12orf49Q9H741 205 aa6.62□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 USP31Q70CQ4 1352 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 FAM170BA6NMN3 283 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 GIPC1O14908 333 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 SDE2Q6IQ49 451 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 FLCNQ8NFG4 579 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 CHRDQ9H2X0 955 aa6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 CES1P23141 567 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 PAK2Q13177 524 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 BSNDQ8WZ55 320 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 NXPE3Q969Y0 559 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 USP11P51784 963 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 IKBKEQ14164 716 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 FBLN7Q53RD9 439 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 USP26Q9BXU7 913 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.59□□□□□ -1.35
USP10-218ENST00000570053 TNFRSF21O75509 655 aa6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 FGRP09769 529 aa6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 USP17L7P0C7H9 530 aa6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 GPRASP2Q96D09 838 aa6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.58□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 DBX1A6NMT0 343 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 GJA8P48165 433 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 OSMRQ99650 979 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 COPRSQ9NQ92 184 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 TBX22Q9Y458 520 aa6.57□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 PHACTR2O75167 634 aa6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ZNF124Q15973 351 aa6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.56□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ADH5P11766 374 aa6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 NFE2L2Q16236 605 aa6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.55□□□□□ -1.36
USP10-218ENST00000570053 PMEPA1Q969W9 287 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms