RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GFRA2	O00451	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DLL1	O00548	723 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AOC2	O75106	756 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WISP1	O95388	367 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SELP	P16109	830 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HDX	Q7Z353	690 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SHD	Q96IW2	340 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GNB5	O14775	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HTR3B	O95264	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GIPR	P48546	466 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIK3R2	O00459	728 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATE1	O95260	518 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IMPDH2	P12268	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PLCG1	P19174	1290 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRK4	P32298	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ID3	Q02535	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PGR	P06401	933 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DRD2	P14416	443 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELN	P15502	786 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDE4B	Q07343	736 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MLEC	Q14165	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRIK4	Q16099	956 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIF1	Q9H611	641 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLF4	O43474	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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