RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB22O15209 634 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 NEDD4P46934 1319 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 SLC15A2Q16348 729 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF384Q8TF68 577 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 XDHP47989 1333 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 TDO2P48775 406 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 AKT1S1Q96B36 256 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 B4E1Z4 1266 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 FERMT3Q86UX7 667 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-204ENST00000352260 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 INCENPQ9NQS7 918 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 FIBPO43427 364 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 GPSM2P81274 684 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 MECOMQ03112 1051 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 CHD4Q14839 1912 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM87BQ96K49 555 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 STK32BQ9NY57 414 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC66A2RUB6 948 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 H3BQV1 296 aa21.61■■□□□ 1.05
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SPNS1-204ENST00000352260 PRDX5P30044 214 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 RESTQ13127 1097 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 KRT23Q9C075 422 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 JAG2Q9Y219 1238 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 BBOX1O75936 387 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 PPARAQ07869 468 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 MPNDQ8N594 471 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 AP5Z1O43299 807 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ATP2B4P23634 1241 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ELP1O95163 1332 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 KRT85P78386 507 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 LY9Q9HBG7 655 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 SENP2Q9HC62 589 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.59■■□□□ 1.05
SPNS1-204ENST00000352260 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 PPFIA3O75145 1194 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 UFL1O94874 794 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 FOSBP53539 338 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 GGA1Q9UJY5 639 aa21.58■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS1-204ENST00000352260 CAVIN2O95810 425 aa21.57■■□□□ 1.04
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