RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 IFFO2Q5TF58 517 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 USP48Q86UV5 1035 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 FBXW7Q969H0 707 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 MXD3Q9BW11 206 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 PPP4CP60510 307 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 GMLQ99445 158 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF213O14771 459 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 MMP14P50281 582 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 VPS53Q5VIR6 699 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 DLK2Q6UY11 383 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 NAPBQ9H115 298 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ARMT1Q9H993 441 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 FGAP02671 866 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 USP17L8P0C7I0 530 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 GRM1Q13255 1194 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 LCORLQ8N3X6 602 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 PALD1Q9ULE6 856 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 CAPNS2Q96L46 248 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 GGA3Q9NZ52 723 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 GAKO14976 1311 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 ADM5C9JUS6 153 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 TDO2P48775 406 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 NEK4P51957 841 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 RASEFQ8IZ41 740 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-201ENST00000324444 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 CYP21A2P08686 494 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ECE1P42892 770 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 TEKT1Q969V4 418 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 FOXN1O15353 648 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 NT5C2P49902 561 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 TRDNQ13061 729 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD1Q15327 319 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 SULF1Q8IWU6 871 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 OGFOD1Q8N543 542 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 NEK1Q96PY6 1258 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 FOCADQ5VW36 1801 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 RUFY3Q7L099 469 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 WBP1LQ9NX94 342 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 F8W031 263 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 FOXP2O15409 715 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 BTDP43251 543 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 USP5P45974 858 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 E7EWF7 191 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 NCOA7Q8NI08 942 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-201ENST00000324444 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
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