RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sirt2Q8VDQ8 389 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 ZwintQ9CQU5 252 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 WtapQ9ER69 396 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Suclg2Q9Z2I8 433 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ano3A2AHL1 981 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mtx1P47802 317 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sec23aQ01405 765 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 DaglaQ6WQJ1 1044 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 SpidrQ8BGX7 933 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpr150Q8BL07 427 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 QarsQ8BML9 775 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Camkk2Q8C078 588 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ndufv1Q91YT0 464 aa18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Casq1-201ENSMUST00000003554 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Metap2O08663 478 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc1a4O35874 532 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Magea6O89010 325 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Me1P06801 572 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Magea3Q6T340 320 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp113Q8C689 439 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spire2Q8K1S6 718 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim59Q922Y2 403 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 RabggtaQ9JHK4 567 aa18.83■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdr19Q3UGF1 1341 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 UncxO08934 530 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf667Q2TL60 609 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bola3Q8CEI1 110 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 DpydQ8CHR6 1025 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zbed3Q9D0L1 228 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ly6iQ9WU67 134 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rgs12Q8CGE9 1381 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sall1Q9ER74 1322 aa18.82■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spata18Q0P557 537 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep63Q3UPP8 700 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep131Q62036 1060 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 B4galnt4Q766D5 1034 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 VmacQ8BP01 174 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cnpy3Q9DAU1 276 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nmt2O70311 529 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rad23bP54728 416 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pus7lQ8CE46 702 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Xrcc4Q924T3 326 aa18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aox4Q3TYQ9 1336 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Peak1Q69Z38 1735 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 FosbP13346 338 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ftl1P29391 183 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Leo1Q5XJE5 667 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nup133Q8R0G9 1155 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Glrx3Q9CQM9 337 aa18.8■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 GabreA2AMW3 916 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prr16A3KMN5 304 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psmd14O35593 310 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 VrtnQ3SYK4 740 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klhdc9Q3USL1 350 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plxnb2B2RXS4 1842 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 SrprbP47758 269 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eef2P58252 858 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc10a5Q5PT54 434 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stac3Q8BZ71 360 aa18.79■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Il7P10168 154 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptpn12P35831 775 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam178bQ24JP3 464 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Llgl2Q3TJ91 1027 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ckap2Q3V1H1 664 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 TrhQ62361 256 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rcan1Q9JHG6 198 aa18.78■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam186bD3Z420 943 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ces1aE9PYP1 563 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 TrdnE9Q9K5 693 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp53P15975 1069 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cacnb3P54285 484 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Npr3P70180 536 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 GnptabQ69ZN6 1235 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc66Q6NS45 935 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ano1Q8BHY3 960 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdk8Q8R3L8 464 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kcnq2Q9Z351 759 aa18.77■□□□□ 0.6
Casq1-201ENSMUST00000003554 TbcaP48428 108 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hirip3Q8BLH7 601 aa18.77■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Terf2ipQ91VL8 393 aa18.77■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klf15Q9EPW2 415 aa18.77■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700003F12RikA2AKE5 210 aa18.76■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psmd1Q3TXS7 953 aa18.76■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lamc2Q61092 1191 aa18.76■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm2163Q6PCY5 473 aa18.76■□□□□ 0.59
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.8 ms