Protein–RNA interactions for Protein: B2RXS4

Plxnb2, Plexin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb2B2RXS4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
Plxnb2B2RXS4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Plxnb2B2RXS4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Plxnb2B2RXS4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Plxnb2B2RXS4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Plxnb2B2RXS4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Plxnb2B2RXS4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Plxnb2B2RXS4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Plxnb2B2RXS4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Plxnb2B2RXS4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Plxnb2B2RXS4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Plxnb2B2RXS4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Plxnb2B2RXS4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Plxnb2B2RXS4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Plxnb2B2RXS4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Plxnb2B2RXS4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Plxnb2B2RXS4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Plxnb2B2RXS4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Plxnb2B2RXS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Plxnb2B2RXS4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Plxnb2B2RXS4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Plxnb2B2RXS4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Plxnb2B2RXS4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Plxnb2B2RXS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Plxnb2B2RXS4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Plxnb2B2RXS4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Plxnb2B2RXS4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Plxnb2B2RXS4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Plxnb2B2RXS4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Plxnb2B2RXS4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Plxnb2B2RXS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Plxnb2B2RXS4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Plxnb2B2RXS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Plxnb2B2RXS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Plxnb2B2RXS4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Plxnb2B2RXS4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Plxnb2B2RXS4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Plxnb2B2RXS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Plxnb2B2RXS4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Plxnb2B2RXS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Plxnb2B2RXS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Plxnb2B2RXS4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Plxnb2B2RXS4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Plxnb2B2RXS4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Plxnb2B2RXS4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Plxnb2B2RXS4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Plxnb2B2RXS4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Plxnb2B2RXS4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Plxnb2B2RXS4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Plxnb2B2RXS4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Plxnb2B2RXS4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Plxnb2B2RXS4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Plxnb2B2RXS4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Plxnb2B2RXS4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Plxnb2B2RXS4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Plxnb2B2RXS4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Plxnb2B2RXS4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Plxnb2B2RXS4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Plxnb2B2RXS4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Plxnb2B2RXS4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Plxnb2B2RXS4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Plxnb2B2RXS4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Plxnb2B2RXS4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Plxnb2B2RXS4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Plxnb2B2RXS4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Plxnb2B2RXS4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Plxnb2B2RXS4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Plxnb2B2RXS4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Plxnb2B2RXS4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Plxnb2B2RXS4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Plxnb2B2RXS4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Plxnb2B2RXS4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Plxnb2B2RXS4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Plxnb2B2RXS4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Plxnb2B2RXS4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Plxnb2B2RXS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Plxnb2B2RXS4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Plxnb2B2RXS4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Plxnb2B2RXS4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Plxnb2B2RXS4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Plxnb2B2RXS4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Plxnb2B2RXS4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Plxnb2B2RXS4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Plxnb2B2RXS4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Plxnb2B2RXS4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Plxnb2B2RXS4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Plxnb2B2RXS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Plxnb2B2RXS4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Plxnb2B2RXS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Plxnb2B2RXS4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Plxnb2B2RXS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Plxnb2B2RXS4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Plxnb2B2RXS4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Plxnb2B2RXS4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plxnb2B2RXS4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Plxnb2B2RXS4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Plxnb2B2RXS4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Plxnb2B2RXS4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Plxnb2B2RXS4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Plxnb2B2RXS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms