Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.31■■■■■ 5
Cacnb3P54285 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cacnb3P54285 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Cacnb3P54285 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Cacnb3P54285 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Cacnb3P54285 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Cacnb3P54285 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Cacnb3P54285 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Cacnb3P54285 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cacnb3P54285 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cacnb3P54285 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Cacnb3P54285 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cacnb3P54285 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cacnb3P54285 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Cacnb3P54285 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cacnb3P54285 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cacnb3P54285 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cacnb3P54285 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cacnb3P54285 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cacnb3P54285 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cacnb3P54285 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cacnb3P54285 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cacnb3P54285 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Cacnb3P54285 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cacnb3P54285 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cacnb3P54285 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cacnb3P54285 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Cacnb3P54285 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cacnb3P54285 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cacnb3P54285 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cacnb3P54285 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cacnb3P54285 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cacnb3P54285 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Cacnb3P54285 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cacnb3P54285 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cacnb3P54285 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cacnb3P54285 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cacnb3P54285 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Cacnb3P54285 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cacnb3P54285 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cacnb3P54285 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cacnb3P54285 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cacnb3P54285 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cacnb3P54285 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cacnb3P54285 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Cacnb3P54285 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cacnb3P54285 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cacnb3P54285 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cacnb3P54285 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cacnb3P54285 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cacnb3P54285 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cacnb3P54285 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cacnb3P54285 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cacnb3P54285 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cacnb3P54285 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cacnb3P54285 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cacnb3P54285 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cacnb3P54285 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cacnb3P54285 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cacnb3P54285 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cacnb3P54285 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Cacnb3P54285 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cacnb3P54285 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cacnb3P54285 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cacnb3P54285 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cacnb3P54285 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cacnb3P54285 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cacnb3P54285 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Cacnb3P54285 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cacnb3P54285 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cacnb3P54285 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cacnb3P54285 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cacnb3P54285 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cacnb3P54285 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cacnb3P54285 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cacnb3P54285 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cacnb3P54285 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cacnb3P54285 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cacnb3P54285 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cacnb3P54285 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cacnb3P54285 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cacnb3P54285 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cacnb3P54285 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cacnb3P54285 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cacnb3P54285 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cacnb3P54285 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cacnb3P54285 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cacnb3P54285 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cacnb3P54285 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cacnb3P54285 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cacnb3P54285 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cacnb3P54285 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cacnb3P54285 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cacnb3P54285 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cacnb3P54285 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cacnb3P54285 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cacnb3P54285 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cacnb3P54285 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cacnb3P54285 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cacnb3P54285 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms