RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q6ZNB5 142 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERBB2P04626 1255 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FZD5Q13467 585 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q8N3U1 123 aa0.06□□□□□ -2.4
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOTCH2Q04721 2471 aa0.05□□□□□ -2.4
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MDN1Q9NU22 5596 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POTEB2H3BUK9 544 aa0.03□□□□□ -2.4
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCTD17Q8N5Z5 321 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1277P-201ENST00000364561 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF787Q6DD87 383 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AMHP03971 560 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EVX2Q03828 476 aa0□□□□□ -2.41
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUC16Q8WXI7 14507 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GABBR2O75899 941 aa-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSRNP1Q96S65 589 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL9A1P20849 921 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa-0.09□□□□□ -2.42
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP10-1P60331 282 aa-0.1□□□□□ -2.43
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 SUV39H1O43463 412 aa-0.14□□□□□ -2.43
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM151AQ8N4L1 468 aa-0.15□□□□□ -2.43
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
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RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYSRT1A8MQ03 144 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRRG2O14669 202 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EGFRP00533 1210 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP10-2P60368 255 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNMA1Q12791 1236 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAMSTRQ6ZN01 415 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYT1LQ9UL68 1186 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ST18O60284 1047 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP10-8P60410 259 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LAPTM4AQ15012 233 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PAX4O43316 350 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP10-12P60413 245 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BSPRYQ5W0U4 402 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIP4P2Q8N4L2 257 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRIP1Q9BX63 1249 aa-0.22□□□□□ -2.44
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