RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 MYOD1P15172 320 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ZNF134P52741 427 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 Q8NAQ8 132 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 HIST1H4GQ99525 98 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ATP5G1P05496 136 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 PLNP26678 52 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 AMTNQ6UX39 209 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 IMUPQ9GZP8 106 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 DKK2Q9UBU2 259 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.36□□□□□ -1.07
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HCG18-241ENST00000602290 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.35□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.35□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.35□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.35□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 RASL10AQ92737 203 aa8.35□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 PROP1O75360 226 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ID1P41134 155 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 PATE2Q6UY27 113 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 GLMPQ8WWB7 406 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 USMG5Q96IX5 58 aa8.34□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 D6R8Y8 96 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 PYYP10082 97 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 GNG5P63218 68 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 C6orf223Q8N319 242 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 TRGV9Q99603 122 aa8.33□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 MORN5Q5VZ52 161 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 C17orf77Q96MU5 243 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 LINC01587Q99440 93 aa8.32□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 Q9H3A6 140 aa8.32□□□□□ -1.08
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.3□□□□□ -1.08
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HCG18-241ENST00000602290 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 K7EMI3 77 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 CKS2P33552 79 aa8.29□□□□□ -1.08
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HCG18-241ENST00000602290 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.29□□□□□ -1.08
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HCG18-241ENST00000602290 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-241ENST00000602290 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.28□□□□□ -1.08
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HCG18-241ENST00000602290 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.28□□□□□ -1.08
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HCG18-241ENST00000602290 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 F8VRH5 84 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A20O43772 301 aa8.27□□□□□ -1.09
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HCG18-241ENST00000602290 NPIPB3Q92617 1050 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 FAM223BA6NKX1 122 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 UQCRQO14949 82 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TCL1BO95988 128 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 ACYP1P07311 99 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 AMN1Q8IY45 258 aa8.26□□□□□ -1.09
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