RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524057.3

SORBS3-222, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, human

TSL 3

Gene SORBS3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SORBS3-222	ENST00000524057		H3BVH4	76 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057		K7EQD1	137 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	NXPH4	O95158	308 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	RIG	Q13278	110 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SORBS3-222	ENST00000524057		A0A1B0GW15	77 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	CRYGD	P07320	174 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	IGLC6	P0CF74	106 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	CAMP	P49913	170 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	HBB	P68871	147 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	GYPE	P15421	78 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	CTRL	P40313	264 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	CACNG7	P62955	275 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		Q0VG73	95 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	TWIST1	Q15672	202 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	SNAI2	O43623	268 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	C14orf144	Q96I85	54 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		A0A1B0GXF2	115 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	NTF3	P20783	257 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	SLA	Q13239	276 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		A0A087WWL8	130 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		M0R381	172 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	APCS	P02743	223 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	RAB4A	P20338	218 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		Q6ZSA8	131 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	TNXB	P22105	4242 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		Q8N814	137 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		A8MWV9	139 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		K7EP13	123 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057		Q8N3U1	123 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SORBS3-222	ENST00000524057	CIDEA	O60543	219 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	SMIM17	P0DL12	118 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	SRI	P30626	198 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057		M0R143	59 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	PSCA	O43653	123 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	SCGB1D1	O95968	90 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	MT1HL1	P0DM35	61 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	EVI2A	P22794	236 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	TIRAP	P58753	221 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	GAGE1	Q13065	139 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	GAGE4	Q13068	117 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	GAGE5	Q13069	117 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	RHOH	Q15669	191 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	C20orf202	A1L168	122 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	AMN1	Q8IY45	258 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	MGP	P08493	103 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SORBS3-222	ENST00000524057	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.11	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.5 ms