RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TCL1B	O95988	128 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZS46	218 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	HERV-K104	P63124	156 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	NRAC	Q8N912	160 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	BRCA2	P51587	3418 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	LAMA3	Q16787	3333 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	RBX1	P62877	108 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM89	A2RUT3	159 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf56	Q8N813	242 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	PIFO	Q8TCI5	191 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	UBL5	Q9BZL1	73 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		J3QKU1	62 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	APOC4	P55056	127 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	PROK1	P58294	105 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YXY3	114 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB4A	O15263	64 aa		6.02	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZTI0	123 aa		6.02	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		6.02	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf74	Q96GX8	76 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		M0QY20	66 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS9	O00182	355 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	COX7B2	Q8TF08	81 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	PRM2	P04554	102 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	NFE4	Q86UQ8	179 aa		6.02	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		6.01	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		6.01	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		6.01	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	AGRN	O00468	2067 aa		6.01	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPR1	153 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		A8MZ25	164 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	LECT2	O14960	151 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	PSCA	O43653	123 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	ODF3	Q96PU9	254 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		6	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	MIA	Q16674	131 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP54	Q96N23	3096 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		H0YGX0	51 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		H3BT86	120 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	COX7A2L	O14548	114 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		Q9HAA7	133 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	DSCR8	Q96T75	97 aa		5.99	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		A0A096LNJ9	63 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	PRORY	Q9H606	182 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	BPTF	Q12830	3046 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	EDN2	P20800	178 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	KLLN	B2CW77	178 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	AVP	P01185	164 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	PSMB8	P28062	276 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		F8WEM9	126 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-33	P01772	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5G1	P05496	136 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	ACYP1	P07311	99 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		Q6YL49	198 aa		5.98	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0B4J2C4	111 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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