RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495517.5

RBM41-208, Transcript of RNA binding motif protein 41, human

TSL 2

Gene RBM41, Length 3,315 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM41-208	ENST00000495517		Q8N8P6	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517		H3BTX0	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	IGLL5	B9A064	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517		F8W1H4	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517		H7C1H1	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517		Q8NAQ8	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517		M0QY20	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	MUC4	Q99102	2169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517		F6UB75	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	AZU1	P20160	251 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	UBE2D1	P51668	147 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM41-208	ENST00000495517	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	ORM1	P02763	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	UBE2D3	P61077	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	UBE2D2	P62837	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517		A0A087WX48	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517		A0A1B0GV72	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517		K7ERJ3	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	WFDC2	Q14508	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	IGKC	P01834	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	FABP2	P12104	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	FXYD7	P58549	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	AMELX	Q99217	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	ATP5L	O75964	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	CD7	P09564	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TSPAN13	O95857	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	AGRN	O00468	2067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	GNRH2	O43555	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TCTA	P57738	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TWIST1	Q15672	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517		H3BVH4	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	DPM2	O94777	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM41-208	ENST00000495517	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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