RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-208	ENST00000471759	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	PDZD2	O15018	2839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	UBE2L6	O14933	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	MLANA	Q16655	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	ESRG	Q1W209	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759		M0R1W7	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	LINC00205	P59089	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	APC	P25054	2843 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759		A0A0J9YXY3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	PDE6H	Q13956	83 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759		Q8N2B8	174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RABGGTB-208	ENST00000471759	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SOCS3	O14543	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SVIL	O95425	2214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	UBE2B	P63146	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	MIA	Q16674	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		E7EUB6	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	PROP1	O75360	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	POLE	Q07864	2286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		K7EMT4	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		M0R381	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SPRY3	O43610	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		Q1T7F1	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		M0R378	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	PSPN	O60542	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	MIF	P14174	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	LYZ	P61626	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		Q6ZVQ6	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	RMI2	Q96E14	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	MTOR	P42345	2549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759		Q0VFX4	171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGGTB-208	ENST00000471759	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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