RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 TENM2Q9NT68 2774 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 SEC11AP67812 179 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 IL17DQ8TAD2 202 aa7.25□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 TSHBP01222 138 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 NMUP48645 174 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 MPV17L2Q567V2 206 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 C16orf74Q96GX8 76 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 MUC4Q99102 2169 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 HSD52Q0P140 79 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 GAGE1Q13065 139 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 CST9LQ9H4G1 147 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 AZU1P20160 251 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 HERVK_113P61574 105 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 MUC7Q8TAX7 377 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-204ENST00000424089 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 A6NDN8 102 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 E9PLD3 99 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 P0DMU3 169 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 FAM231AP0DMU4 169 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 FAM231CP0DMU5 169 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TAL2Q16559 108 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 CASC10Q5T4H9 136 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 PCP2Q8IVA1 136 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 OR11H2Q8NH07 326 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 RYR2Q92736 4967 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf86A6NJI1 115 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 RRN3P1Q2M238 152 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 NFE4Q86UQ8 179 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 VCX2Q9H322 139 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 COX11Q9Y6N1 276 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 LCE6AA0A183 80 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 PRM2P04554 102 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 COTL1Q14019 142 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZSN1 163 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 K7EQD1 137 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 AMELXQ99217 191 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TM2D2Q9BX73 214 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 AGRNO00468 2067 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 H3BRM9 83 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TAX1BP3O14907 124 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZTI0 123 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF479Q96JC4 524 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1A-204ENST00000424089 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.5 ms