RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.94□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 KIR2DL4Q99706 377 aa14.94□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 LINC01549A6NIU2 74 aa14.93□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 TSHBP01222 138 aa14.93□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 ERASQ7Z444 233 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 NMUP48645 174 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 EMP1P54849 157 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 TCTAP57738 103 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 I3L3M4 83 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 PLNP26678 52 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 SIVA1O15304 175 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-202ENST00000420138 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 F8VRH5 84 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 A8MZ25 164 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 BAALCQ8WXS3 180 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.88□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 RHOHQ15669 191 aa14.88□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 PCP2Q8IVA1 136 aa14.88□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 OR11H2Q8NH07 326 aa14.88□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.87□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 RNF183Q96D59 192 aa14.87□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.87□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.87□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.86□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 IGIPA6NJ69 53 aa14.86□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 K7EQD1 137 aa14.86□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 CIDEAO60543 219 aa14.86□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 Q8NAQ8 132 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 TMEM141Q96I45 108 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 FHL2Q14192 279 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.85□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.84□□□□□ -0.03
GPC1-202ENST00000420138 DEFB130BP0DP73 79 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 DEFB130AP0DP74 79 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 TIMM17AQ99595 171 aa14.83□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 DEFB4AO15263 64 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 MIFP14174 115 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 HSD52Q0P140 79 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 GAGE1Q13065 139 aa14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 LYRM9A8MSI8 78 aa14.81□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.81□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.81□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 COX11Q9Y6N1 276 aa14.81□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 HIGD1BQ9P298 99 aa14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 UBE2D3P61077 147 aa14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 UBE2D2P62837 147 aa14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 PMVKQ15126 192 aa14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.79□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.79□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 SEC11AP67812 179 aa14.79□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 GAGE12JA6NER3 117 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 GAGE4Q13068 117 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 GAGE5Q13069 117 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 GAGE13Q4V321 117 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 CELA1Q9UNI1 258 aa14.78□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 NOTCH1P46531 2555 aa14.77□□□□□ -0.04
GPC1-202ENST00000420138 Q6ZVH6 145 aa14.77□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 CST9LQ9H4G1 147 aa14.77□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 TAX1BP3O14907 124 aa14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 COTL1Q14019 142 aa14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 FAM104AQ969W3 186 aa14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 RETNQ9HD89 108 aa14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.75□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.75□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 LINC00694P0DN24 101 aa14.75□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.75□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.75□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.74□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.74□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.74□□□□□ -0.05
GPC1-202ENST00000420138 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms