RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SSC5DA1L4H1 1573 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NPFFO15130 113 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SOGA1O94964 1423 aa0.17□□□□□ -2.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.13□□□□□ -2.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 V9GYV3 84 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.13□□□□□ -2.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 TACC2O95359 2948 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 F8P00451 2351 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 GRIN2AQ12879 1464 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CDH23Q9H251 3354 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 A6NIN4 97 aa0.12□□□□□ -2.39
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