RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRBAP50851 2863 aa16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMIM9A6NGZ8 99 aa16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAND5Q8N907 189 aa16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFA1O15239 70 aa16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRACP01848 142 aa16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MED13LQ71F56 2210 aa16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAMA5O15230 3695 aa16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP5J2P56134 94 aa16.58■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 K7EMT4 169 aa16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBL1P41271 181 aa16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00308Q8TCZ7 52 aa16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C22orf24Q9Y442 160 aa16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACACAQ13085 2346 aa16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM222AQ5U5X8 452 aa16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGKV3-20P01619 116 aa16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PF4V1P10720 104 aa16.56■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATOX1O00244 68 aa16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BAALC-AS2P0C853 105 aa16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EDN2P20800 178 aa16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHG2P01859 326 aa16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.55■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TIRAPP58753 221 aa16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COPS9Q8WXC6 57 aa16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa16.53■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.52■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMO4P61968 165 aa16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q8N2B8 174 aa16.51■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PROK1P58294 105 aa16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR13C6PQ8NH95 151 aa16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WIPF1O43516 503 aa16.49■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q9H8V8 135 aa16.48■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 hADV29S1A0JD25 119 aa16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCL21O00585 134 aa16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDSNQ15517 529 aa16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF152Q8N8N0 203 aa16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATMQ13315 3056 aa16.47■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV1-40P01703 118 aa16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM218AQ96MZ4 157 aa16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRORYQ9H606 182 aa16.46■□□□□ 0.23
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIEZO1Q92508 2521 aa16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBTD1Q9HAC8 227 aa16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 K7EQG2 157 aa16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM258P61165 79 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF415Q09FC8 603 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LY6EQ16553 131 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF292O60281 2723 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BPESC1Q9GZL8 116 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYSTM1Q9H1C7 97 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q9UF83 564 aa16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0U1RRA0 63 aa16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MALP21145 153 aa16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COX6A2Q02221 97 aa16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRD3OSQ6XYD6 125 aa16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZSN1 163 aa16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DPH3Q96FX2 82 aa16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKAP13Q12802 2813 aa16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KNCNA6PVL3 124 aa16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UPK3BQ9BT76 320 aa16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SVEP1Q4LDE5 3571 aa16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BLCAPP62952 87 aa16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6JHZ5 121 aa16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A6NDX4 124 aa16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBMY1CP0DJD4 496 aa16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16.38■□□□□ 0.21
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