RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 FCER1GP30273 86 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00518Q8N0U6 118 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-53P01767 116 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 PRM2P04554 102 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 BTF3P20290 206 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A12P80511 92 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf57Q99622 126 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB135Q30KP9 77 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 OR11H2Q8NH07 326 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF183Q96D59 192 aa16.28■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 NUDT3O95989 172 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-11P60412 298 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 UFSP1Q6NVU6 142 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZTI0 123 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM70Q9BUB7 260 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5LO75964 103 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 X6R8D5 127 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE12BA1L429 117 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 I3L3M4 83 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE7O76087 117 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 GAS8-AS1O95177 125 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE12FP0CL80 117 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE12GP0CL81 117 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE12IP0CL82 117 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFA6Q01524 100 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PLAC8L1A1L4L8 177 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOHQ15669 191 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PMCHL1Q16048 86 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 C18orf15Q96N68 181 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 G3V4G9 280 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 EMP1P54849 157 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PYY3Q5JQD4 70 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PET117Q6UWS5 81 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf79P0CE67 100 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.21■□□□□ 0.19
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EQD1 137 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 CYSLTR1Q9Y271 337 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SPART-AS1P0CW21 52 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00612Q8N6U2 182 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF479Q96JC4 524 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB130BP0DP73 79 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB130AP0DP74 79 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 VWFP04275 2813 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 DAD1P61803 113 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 TOMM6Q96B49 74 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 COTL1Q14019 142 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM222AQ5U5X8 452 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZN92 141 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB3A1Q96QR1 104 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-212ENST00000591041 NOTCH1P46531 2555 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A096LNJ9 63 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS1P07477 247 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8NAQ8 132 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM141Q96I45 108 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 DKK2Q9UBU2 259 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 ERASQ7Z444 233 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 VAMP8Q9BV40 100 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5G1P05496 136 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO0255Q9UI72 69 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TSTD3H0UI37 97 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 H0Y8G0 127 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TSHBP01222 138 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 NPSP0C0P6 89 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZSN1 163 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-212ENST00000591041 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.09■□□□□ 0.17
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