RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC32Q5I0X7 151 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LELP1Q5T871 98 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 ISOC2Q96AB3 205 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 AP1S3Q96PC3 154 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 KMT2AQ03164 3969 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CTRLP40313 264 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFA5Q16718 116 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CLLU1Q5K131 121 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TSKUQ8WUA8 353 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 V9GYV3 84 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WWC5 75 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GUT8 65 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 HIGD1CA8MV81 97 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 M0QY20 66 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00694P0DN24 101 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2D3P61077 147 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2D2P62837 147 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TNP2Q05952 138 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CT83Q5H943 113 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 BORCS7Q96B45 105 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RYR2Q92736 4967 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM262E9PQX1 116 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 H7C1H1 209 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RASL11AQ6T310 242 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 GATD1Q8NB37 220 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP35Q8NFH5 326 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CNFNQ9BYD5 112 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NIT2Q9NQR4 276 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GVY2 172 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM231BA6NCW3 169 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 S100A1P23297 94 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RIGQ13278 110 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 Q9HAA7 133 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 K7EP13 123 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB4AP20338 218 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMPP49913 170 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 NFE4Q86UQ8 179 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 NIT1Q86X76 327 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WX48 190 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM218A2RU14 115 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 F8W036 122 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 PSCAO43653 123 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 GAS8-AS1O95177 125 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE6Q13070 117 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 COMMD7Q86VX2 200 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 AMN1Q8IY45 258 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF185Q96GF1 192 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 KLK12Q9UKR0 248 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.57□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 SMKR1H3BMG3 65 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R2P9O14990 202 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 MT-ND4LP03901 98 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 PMCHP20382 165 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 UQCC3Q6UW78 93 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N976 141 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2WQ96B02 151 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.56□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00862A6NCI5 91 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-211ENST00000588374 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms